华大等机构发布苏铁完整基因组图谱

来源:国际在线    2022-04-20 13:53
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近日,华大联合多家科研单位完成苏铁基因组解析工作,发布苏铁完整基因组图谱。4月18日,《自然-植物》(Nature Plants)以封面文章发表该研究成果。本次发布的苏铁基因组,代表着种子植物基因组演化研究中的最后一块拼图已顺利完成。

华大等机构发布苏铁完整基因组图谱

苏铁是地球上现存最古老的种子植物,是著名的“活化石”植物。作为最原始的种子植物,苏铁具有极其重要的科学价值、生态价值和经济价值,可以说是“植物界的大熊猫”。然而,苏铁的基因组较大,结构复杂,为科学研究工作增添不少难度。现存最原始种子植物中,仅苏铁分支一直缺少完整的基因组图谱。

华大等机构发布苏铁完整基因组图谱

据华大生命科学研究院刘欢研究员介绍,该研究选取苏铁类最基部的类群、同时也是中国特有的古老残遗种-攀枝花苏铁作为测序材料,吸引了植物学领域国际顶级专家加入,最终由国内外22个机构,60多名科学家共同参与完成,研究成果数据公开共享,全球科学家可免费下载使用。

本次研究在苏铁溯源认祖、重建家谱上意义重大。基于现存苏铁目339种植物的转录组数据,研究团队重建了苏铁类自身的系统发育关系,确定了苏铁演化的完整历史。此外,该研究在种子植物的祖先节点共发现663个新获得的基因家族和368个扩张的基因家族,推断现存裸子植物的最近共同祖先可能经历了一次古老的全基因组复制事件。

本次研究也发现,苏铁虽然有毒性,但是依然具有造福意义。据了解,研究团队在基于苏铁类339个物种转录组数据,研究发现该毒素蛋白只在苏铁中存在,且在苏铁种子和根部高表达,目前尚未在其它植物中发现。虽然毒性限制了苏铁的食用功能,但不妨碍它在人类社会发挥用处。

华大等机构发布苏铁完整基因组图谱

此外,了解一个物种的性别比例,对其繁衍延续、科学保护等具有重要意义。苏铁的性别控制基因问题,困扰科学界已久。本次研究发现了苏铁的性别决定相关基因,揭示了苏铁性别决定的遗传机制,意义重大。

除了在上述农业方面具有可观的应用前景之外,苏铁还有着很多待研究发掘的实用价值,譬如药用价值上,苏铁全身均可入药,叶片提取物有抗癌活性,在治疗癌症、艾滋病、肝脏疾病等多种疾病的药物中均有应用。此次研究在苏铁种子储存蛋白中发现的营养功能、抗菌功能等,也无一不预示着苏铁将为生态保护、人类生活与健康带来更多可能性。

一直以来,做好生物多样性保护工作,对全球生态文明建设、人类文明发展具有重要意义。未来,华大将秉持持续推进植物基因组学研究,为生态保护、社会可持续发展做出更多贡献。

 

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【责任编辑:钟经文】
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